W tej sali odbyło się także słynne Colloqium Charitativum – braterska rozmowa pomiędzy katolikami a protestantami – zwołane w 1645 roku przez króla Władysława IV Wazy, mające załagodzić spory religijne. Tu również, 18 stycznia 1920 r., burmistrz niemiecki przekazał władzę nad miastem przedstawicielowi odrodzonej Rzeczypospolitej Polskiej. W lipcu 1724 roku w Toruniu wybuchły zamieszki na tle religijnym, nazwane później tumultem. Protestanci zaatakowali i zdemolowali kolegium jezuickie po incydencie podczas procesji Bożego Ciała. Sąd kanclerski skazał burmistrza Torunia i dziewięciu uczestników zamieszek na karę śmierci. Protestancki kościół Marii Panny przeszedł w ręce zakonu bernardynów, a Rada miasta wprowadziła równowagę wyznaniową. Wydarzenia w Toruniu wywołały reakcje w Europie i wzmocniły kampanię protestancką przeciwko Rzeczypospolitej.